Великая Отечественная война застала его на должности председателя колхоза «Красное знамя» деревни Яковск Рябчевского с/совета Трубчевского р-на Орловской, ныне Брянской области.
С оккупацией Трубчевского района немецко-фашистскими войсками, по заданию райкома партии, был оставлен в тылу врага для подпольной работы и организации партизанского отряда. С этой целью вошел в доверие к немцам и был назначен старостой в деревне Яковск. На этой должности проработал 18 дней.
При строгой конспирации от немцев, Михаил Митрофанович и Иван Моисеевич Кабанов, работник лесхоза, подготовили базу для партизанского отряда в урочище Хоменкина хатка, в 15 км от посёлка Гавань, где были построены землянки.
Продукты, которые население собирало для немцев, по распоряжению старосты, направлялись в лес. Сюда же направлялись военнослужащие, которые попали в окружение или бежали из немецкого плена. 16 января 1942 года по указанию подпольного райкома партии был организован боевой партизанский отряд в деревне Яковск, в последующим получивший имя Орджоникидзе - одного из крупнейших руководителей Советского государства. Юдин Михаил Митрофанович был назначен первым командиром этого отряда.
Несмотря на строгую конспирацию, в отряд под видом раненого военнослужащего был специально направлен немцами диверсант, но он был вовремя разоблачен.
В партизанском отряде под командованием М.М. Юдина было 98 человек. Из них коммунистов было 11 человек, комсомольцев 14 человек. В отряде имелось боевое оружие: станковых пулеметов «Максим» - 2, ручных пулеметов – 8, противотанковое ружье - 1, около 100 винтовок. Затем оружие стали пополнять за счет военных трофеев, добытых в боях.
Комиссаром отряда назначили бывшего прокурора района Зяму Моисеевича Казакевича из Головного партизанского отряда. Заместителем командира отряда - жителя дер. Копылино старшего лейтенанта Федора Ивановича Конахина. Начальником штаба отряда - окруженца старшего лейтенанта Ивана Михайловича Иванникова. Начальником боеснабжения –жителя д. Яковск Ивана Моисеевича Кабанова. Командирами взводов –старший лейтенант Залико Коберидзе, лейтенант Алексей Ковалев. Политруками взводов - Борис Файбусович, Сергей Елизаров, Тихон Стефанов, Владимир Ямщуков. Секретарем партийной организации был политрук Тихон Сидорович Стефанов, а секретарем комсомольской организации - Александр Терёшин.
Слева направо: Юдин М.М., Ижукин А.И., Савкин А.В.
Партизанский отряд имени Орджоникидзе под руководством М.М. Юдина участвовал во многих боевых операциях против оккупантов и полицаев на территории Выгонического, Трубчевского, Суземского Почепского районов.
19 января 1942 года в деревне Милечь Почепского района был разгромлен немецкий полицейский штаб, убито 26 гитлеровцев, перешли на сторону партизан 8 венгров, 11 полицейских, бой длился 4 часа. Немцы назвали этот бой внезапным нападением.
17 февраля 1942 года в здании школы на окраине села Юдин М.М. проводил собрание о создании радутинского партизанского отряда.. Присутствовали И. С. Сенченков и А.Д. Бондаренко. В тот же день произошел бой партизан с колонной немцев и полицаев, направлявшихся в с. Радутино. Партизаны заставили их отступить. Из колонны врагов было убито 12 и взято в плен 6. Партизаны потеряли убитыми три товарища и четверо было ранено.
11 марта 1942 года немцы попытались восстановить свои позиции и взять Радутино с ходу, но партизаны были готовы к обороне. Партизанский отряд им. Орджоникидзе принимал участие в 6ти часовом бое партизан с фашистами и полицией.
22 мая 1942г. в четыре часа утра отряд развернул наступление на станцию Хмелево. Было захвачено караульное помещение, пленено 20 немцев, в том числе 2 офицера, патрули, охраняющие мост были все уничтожены. Мост был взорван. Это задержало движение поездов на двое суток.
23 июня 1942г. под Пральней, ныне Зеленая Роща, немцы четырьмя батальонами наступали на отряд Орджоникидзе при помощи танков и четырех самолетов. Отряд, при поддержке партизан отряда им. Димитрова, остановил танковую колонну.
В феврале 1943 года, в ходе очередной боевой операции, Михаил Митрофанович был тяжело контужен. Самолетом эвакуирован на Большую землю.
После продолжительного лечения в госпитале направлен на административно-хозяйственную работу в г. Болхов Орловской области. Заведовал районным земельным отделом.
В 1950 г. Юдин М.М. вернулся в Трубчевский район, был председателем колхоза в Фомчино. В начале 1960-х работал в колхозе им. Кутузова заведующим Радутинской молочнотоварной фермой. Последние годы работал председателем исполкома Радутинского сельского Совета. Михаил Митрофанович участвовал в военно – патриотическом воспитании учеников Радутинской школы.
Осенью 1968г. состоялась встреча партизан отряда имени Орджоникидзе. На ней присутствовали боевые товарищи Михаила Митрофановича, приехавшие из разных городов Советского Союза и добившиеся успехов в мирной жизни. Комиссар отряда Тихон Сидорович Стефанов - начальник СМУ в Хмельницком. Начальник штаба отряда Иван Михайлович Иванников - директор средней школы в Ташкенте. Командир взвода Залико Минаевич Коберидзе - в торговой сети в Тбилиси. Политрук взвода Владимир Петрович Ямщуков - журналист в Москве.
Михаил Митрофанович Юдин на любом посту не жалел сил и энергии для выполнения своего долга, верно служил делу партии и народа. Коберидзе отзывался о своем товарище, как о боевом командире, настоящем мужественном человеке, патриоте Родины.
За боевые и трудовые заслуги Михаил Митрофанович был награжден Орденом Отечественной войны II степени, пятью медалями.
В 1972 году товарищ Юдин получил персональную пенсию. Но тяжелая болезнь оборвала жизнь партизанского командира и умелого руководителя 3 июля 1973 года. Похоронили Михаила Митрофановича в его родном селе Радутино.
Автор: научный сотрудник С.И. Самошкина